Чтобы исключить дублирование данных, ФНС России выпустила рекомендации (Письмо от 24.07.2026 № СД-36-15/6410@) по учету прослеживаемых товаров для лиц, применяющих упрощенную систему налогообложения.
Порядок регистрации операций зависит от того, по какой ставке НДС работает налогоплательщик:
Ведение книги продаж
Если у налогоплательщика на УСН возникает обязанность исчислять и уплачивать НДС, он обязан заполнять книгу продаж. В ней регистрируются счета-фактуры, включая документы с реквизитами прослеживаемости.
Общие ставки НДС (10%, 20%, 22% и расчетные 10/110, 20/120, 22/122)
При использовании этих ставок операции по приобретению прослеживаемых товаров необходимо отражать в книге покупок.
«Упрощенные» ставки НДС (5%, 7% и расчетные 5/105, 7/107)
В этом случае налоговые вычеты по входному НДС не применяются. Операции по приобретению подлежащих прослеживаемости товаров отражаются в специальном отчете об операциях с товарами, подлежащими прослеживаемости.
Такое разделение учета в зависимости от ставки НДС позволяет не вносить одни и те же сведения одновременно в книгу покупок и в отчет по прослеживаемости.